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网监支队是地市级公安机关的下属职能部门。

网监总队是省厅级公安机关的下属职能部门。

两者没有隶属关系，总队可对支队进行业务指导，并对相应工作提出意见和建议，但无决定权，不是命令。这与我国政府机构条块结合，以块为主的结构相符合。网监公安机关的一种工作任务，而网警是从事这项工作的警察，做网监的一定是网警，网警不一定在网监部门，比如刑侦部门也有类似的工作内容。

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